Er zijn een groot deel van de instellingen voor hoger onderwijs in Kirgizië. Dit omvat ongeveer zevenendertig openbare universiteiten en achttien particuliere universiteiten. Prominente universiteiten in Kirgizië zijn Universiteit van Centraal-Azië en Kirgizische National University.

Vereisten voor de PhD-programma gaat het vaak om de student die reeds behaalde een Master's degree. Daarnaast moet een scriptie of proefschrift voornamelijk bestaande uit originele wetenschappelijk onderzoek worden ingediend. In sommige landen kan dit werk nog moeten worden verdedigd voor een panel.