De Vinohrady gezondheidszorg campus begonnen met de ontwikkeling ervan in het begin van de 20e eeuw, toen de stad periferie. In 1902, de keizer Franz Joseph I ingehuldigd de Vinohrady Ziekenhuis als de primaire ziekenhuis voor de burgers van Královské Vinohrady en Žižkov districten. In 1925 werd het Nationale Gezondheidsinstituut Openin haar omgeving. Beide instellingen begon al snel te spelen een belangrijke rol in de ontwikkeling van de gezondheidszorg in Praag en Tsjecho-Slowakije. Voorafgaand aan de verdeling van de Faculteit der Geneeskunde in 1953, beide Instellingen heeft gediend om de opleiding van medische studenten, gebaseerd op systematische activiteit van hun opmerkelijke personeel.
Van de Vinohrady Hospital, er waren namelijk de Prof. Oogheelkunde Josef Janků, de ontdekker van oogheelkundige toxoplasmose (M. Jankumi); Prof. van Lung en Abdominale Heelkunde Emerich Polák; de oprichter van de Tsjechische plastische chirurgie Prof. František Burian. Na de Tweede Wereldoorlog: de oprichter van de Tsjechoslowaakse diabetologie Prof. Jiří Syllaba, een beroemde cardioloog prof Vratislav Jonáš, de stichter van de Tsjechische pediatrische hematologie Dr. Jiří Janele, Prof. Neurologie J. Šebek, Prof. Forensische Geneeskunde E. Knobloch of het hoofd van de Psychiatric Institute doc. V. Petráň.
Van het personeel Nationale Gezondheidsinstituut namelijk: Prof. Ivan Honl, die de eerste therapeutische Pasteur Instituut voor de terrritory van onze staat ingesteld. De medewerkers van dit instituut deelgenomen aan tal van wereldwijde programma's van de World Health Organization na de Tweede Wereldoorlog, onder andere in de wereldwijde uitroeiing van pokken (Prof. Karel Raška). Op basis van zo'n rijke traditie, het haalbaar was om een nieuwe medische faculteit vast te stellen op het Vinohrady gezondheidszorg campus.
Onze Faculteit verwijst naar de traditie van de medische studies aan Charles University en vormde een van de vier fundamentele thema's bij de oprichting in 1348. Vanaf het academiejaar 1882-1883, de Faculteit der Geneeskunde, net als de rest van de universiteit, was verdeeld in twee delen - Duits en Tsjechisch. Op 17 november 1939, samen met alle andere Tsjechische scholen, de Tsjechische deel van de universiteit werd gesloten. Deze tijdelijke stopzetting van de Tsjechische onderwijs duurde tot 1945. Vervolgens, samen met de hele Duitse University, de Duitse Faculteit der Geneeskunde afgeschaft. Het pand werd overgedragen aan de Tsjechische Faculteit der Geneeskunde. In 1953 het ministerie van Hoger Onderwijs verdeelde de Faculteit der Geneeskunde in Praag in drie afzonderlijke faculteiten: de Faculteit der Algemene Geneeskunde (inclusief tandheelkunde), de Faculteit voor Kindergeneeskunde en de Faculteit der Hygiene. Deze laatste werd omgevormd tot de huidige 3 Faculteit der Geneeskunde in 1990.The feit dat er een nieuwe onafhankelijke Faculty of Hygiene werd opgericht in 1953 bracht over een aantal fundamentele veranderingen: deze faculteit behouden een elementaire medische focus, hoewel het zich gespecialiseerd op het gebied van hygiëne en preventie. Aan de ene kant staat deze specialisatie aan alle takken van de hygiëne in onze naoorlogse medicijnen te ontwikkelen, maar aan de andere kant op hetzelfde moment beperkt en beperkt de omvang van de realisatie van studenten in de klinische praktijk.
De medische instructie op het communistische tijdperk werd gebrandmerkt door een nogal formalistisch en cadre aanpak. Sinds november 1989 kunnen we alle wezenlijke veranderingen in de organisatie van de faculteit voorwaarde voor de realisatie van het nieuwe curriculum en studie hervormingen door te voeren zijn geweest. De naam van de faculteit werd veranderd in de 3e Faculteit der Geneeskunde, Charles University, dat zijn primaire algemene nadruk onderstreept. Assoc. Prof. Cyril Höschl, MD, was de eerste decaan van de faculteit verkozen in de vrije verkiezingen na de revolutie in 1989. De Academische Senaat werd opgericht vervolgens samen met de Wetenschappelijke Raad die tegenwoordig werft vele uitstekende buitenlandse leden. Er waren wedstrijden voor alle leidende posities op bepaalde instituten, klinieken, en voor andere universitaire posities. Het curriculum is geherstructureerd, zodat het studieplan weerspiegelt de algemene oriëntatie van de faculteit het integreren van een ontwikkeld gebied van preventieve onderwerpen. Tal van medewerkers uit diverse afdelingen van het ministerie van Volksgezondheid en de Academie van Wetenschappen van de Tsjechische Republiek zijn rechtstreeks betrokken bij de pedagogische evenals onderzoeksactiviteiten van de faculteit.
In september 1992 werd een nieuw faculteitsgebouw op Ruská straat werd geopend. Het herbergt het decanaat, verschillende theoretische departementen, ministeries van hygiëne en preventieve onderwerpen, en, last but not least, het Center for Scientific Information, pas in 1992 opgericht. In mei 1991 mevrouw Margaret M. Bertrand, een Canadese professor van het Engels taal, stichtte een prijs voor de beste student van de faculteit jaarlijks bij de diploma-uitreiking worden toegekend. De voorwaarden voor studie en wetenschappelijk werk zijn verbeterd met de opening van het nieuw gebouwde 6e verdieping van het hoofdgebouw faculteitsgebouw mei 2000, de opvang van onder andere het ministerie van Voeding en laboratoria van chemie en moleculaire biologie. Verdere verbetering is gekomen mei 2006 met het gereconstrueerd deel van de Nursing College op Ruská 91, waar de afdeling Medische Ethiek, Verpleegkunde en vreemde talen zijn nu gebaseerd. Students' bezoeken aan het buitenland worden steeds een onuitwisbaar deel van het onderwijs van de faculteit. Deelname aan internationale wetenschappelijke en onderzoeksprogramma's en lezingen door buitenlandse specialisten in staat de faculteit om zijn vleugels uit te slaan en vast te stellen nieuwe wederzijds voordelige wetenschappelijke beurzen. Dit vergemakkelijkt de verbetering van de kwaliteit van het onderwijs materiaal, onderzoeken van nieuwe methoden, procedures en benaderingen, waardoor technische voorwaarden die onmisbaar zijn voor het bereiken van een hoger niveau van het onderwijs te creëren.
De 3 Faculteit der Geneeskunde verleende zijn onderwijs graden naar vele uitstekende persoonlijkheden in de afgelopen drie jaar, een van de meest prominente waren: Prof. Zdeněk Neubauer in de biologie, Doc. Ivan M. Havel in kunstmatige intelligentie, en Prof. Luboslav Starka in endocrinologie. Op hetzelfde moment, enkele tientallen lezingen door bekende buitenlandse specialisten vond plaats op het terrein van de faculteit. Laten we noemen ten minste de Nobelprijswinnaar in neurofysiologie Prof. J. Eccles, beroemde specialist in psychiatrie Prof. P. Grof en Daseins-analytische Prof. Condrau. Zoals door de Wetenschappelijke Raad van de faculteit, Sir Karl Raimund Popper (1902-1996), epistemologist, open samenleving voorstander, een van de grootste filosofen van de twintigste eeuw voorgesteld, werd bekroond met de graad van doctor honoris causa in de geneeskunde op 25 mei 1994. De 3e faculteit Geneeskunde was een feestje in de toekenning van een eredoctoraat aan een van de ontdekkers van DNA, Nobelprijswinnaar, Prof. James Watson. Ook ter gelegenheid van het 650-jarig bestaan van de Charles University stichting, hebben we voorgesteld dat een andere Nobelprijswinnaar, een wereldwijd bekend neurofysioloog, Professor Huxley uit Groot-Brittannië, ook bekroond met een eredoctoraat in 1998.
MUDr. P. Čech van onze faculteit begonnen met de plaatsing van de ere-plaques in het geheugen van de Nobelprijswinnaars in Medicine Mr. en mevrouw Cori hun geboorteplaats huizen in Salmovska en Petrska straten in Praag binnen het project in Praag-Culturele hoofdstad van Europa 2000. De samenwerking tussen de afzonderlijke faculteiten van de universiteit, met name de faculteiten Geneeskunde, is op de stijging. De universiteit ondersteunt een gezonde concurrentie in de sport activiteiten tussen faculteiten en studenten nemen ook deel aan diverse sociale en culturele evenementen, niet alleen in dit land maar in het buitenland. De faculteit publiceert VITA NOSTRA tijdschrift, als gevolg van het academische leven van de gemeenschap en het vertegenwoordigen van diverse kanten van de faculteit in twee functioneel verschillende kwesties: VITA NOSTRA REVUE, een driemaandelijkse verzameling van artikelen, commentaren en reflecties, en VITA NOSTRA SERVIS, een informatiebulletin die wordt betaald wekelijks. In het academisch jaar 1991-1992 nam de faculteit op buitenlandse studenten in de huisartsgeneeskunde met de focus op preventie. De voertaal is Engels. De rechten en plichten van de buitenlandse studenten zijn vastgelegd in de overeenkomst tussen de student en de decaan van de faculteit contracten.
Nieuwe eisen van de moderne geneeskunde aan artsen worden weerspiegeld in het nieuwe curriculum of Medicine, waarin de faculteit is de uitvoering sinds het academiejaar 1996-1997.
De leer van de basis 3. LF omvat de Faculty Hospital Královské Vinohrady, Psychiatrisch Centrum Praha, ziekenhuis Na Bulovce, Thomayer ziekenhuis, Instituut voor moeder- en kindzorg, Ziekenhuis Na Homolce, Centraal Militair Hospitaal en The National Institute of Public Health. Vooraanstaande deskundigen van de Tsjechische Academie van Wetenschappen en het Instituut voor Klinische en Experimentele Geneeskunde ook deelnemen aan het onderwijs.